Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim38Q5SZ99 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim38Q5SZ99 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Trim38Q5SZ99 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trim38Q5SZ99 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim38Q5SZ99 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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