Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scarf1Q5ND28 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarf1Q5ND28 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms