Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig2Q52KR2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms