Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spire1Q52KF3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms