Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srbd1Q497V5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms