Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms