Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp48Q3V0C5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms