Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B230104I21RikQ3USW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms