Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28047Q3US59 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms