Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms