Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnrc6cQ3UHC0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms