Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cops9Q3U898 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cops9Q3U898 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cops9Q3U898 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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