Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Otud5Q3U2S4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Otud5Q3U2S4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Otud5Q3U2S4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Otud5Q3U2S4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Otud5Q3U2S4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud5Q3U2S4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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