Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc174Q3U155 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms