Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms