Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uri1Q3TLD5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uri1Q3TLD5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms