Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms