Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Eepd1Q3TGW2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eepd1Q3TGW2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms