Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Shroom4Q1W617 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shroom4Q1W617 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms