Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd3Q14AI6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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