Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne7Q0VE82 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms