Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms