Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms