Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc3h18Q0P678 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms