Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms