Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou6f1Q07916 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms