Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprgQ05909 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms