Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms