Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms