Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcd1Q02242 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcd1Q02242 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms