Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EgfrQ01279 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EgfrQ01279 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms