Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbp4Q00724 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms