Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SeleQ00690 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms