Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfcP97953 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfcP97953 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms