Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bop1P97452 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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