Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms