Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms