Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp3P70281 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms