Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ybx1P62960 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ybx1P62960 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ybx1P62960 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ybx1P62960 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ybx1P62960 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms