Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms