Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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