Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms