Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtskP55097 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtskP55097 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms