Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms