Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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RabggtbP53612 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RabggtbP53612 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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