Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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