Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbrP50284 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms