Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms