Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf5P43027 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf5P43027 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms