Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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